Ориентируйтесь на инвентаризацию выбросов в проекте ПДВ там разбивка по цехам, и в каком цехе у Вас какие выбросы.
Соответственно, если на момент действия старого разрешения были "старые" источники , действовали на период действия разрешения.
Они , ваши старые подразделения и будут фигурировать в расчете на кокой то период в 2017 году действия "старого" разрешения.
Соответственно, в новом разрешении - вы не указываете подразделения которых уже нет.
Т.е. сам расчет по выбросам получается более расширенный , в соответствии с периодами действия 2-х разрешений.